Иена известна своей прославленной на весь мир оптикой Карл-Цейс-Йена и университетом, основанным в 1558 г. В этом заведении преподавали Шиллер, Фихте и Гегель. Самым старым зданием в университете является Коллегиум Йенензе. Главное здание было построено Теодором Фишером в 1905-08 гг. В университетский комплекс входит также комплекс зданий цилиндрической формы с башней высотой 120 м, строительство которой завершилось в 1972 г., ее еще называют «йенский фаллос». На главной площади Марктплатц стоит ратуша
XV в. Каждый час фигура, прозванная Хваталыцик Ганс (Шнаппханс), пытается поймать мяч — символ человеческой души. Неподалеку стоит готическая церковь св. Михаила XV- XVI вв. В городском музее Альте Гёрэ можно увидеть интересную коллекцию, посвященную истории этих мест. Стоит посетить Роман-тикерхаус, расположенный на Унтерер Маркт. Здесь когда-то жил Иоганн Готлиб Фихте, а теперь расположен музей, посвященный романскому периоду. Заслуживают внимания великолепный Музей оптики, рассказывающий об истории оптического производства Карла Цейса и Цейс-планетариум, самый старый планетарий такого типа. На севере находится музей, посвященный творчеству поэта, политика и ученого Иоганна Вольфганга Гёте — Гёте-геденкштэтте.
Окрестности: в Дорнбурге (12 км на северо-восток) расположены три дворца: готический Старый замок, переделанный в стиле Возрождения, ренессансный замок (1539-47) и очаровательный замок в стиле рококо (1736-41).